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    科研進展

    青海省重大專項“三江源區代表性動物基因資源保護與應用”通過驗收

    發表日期:2023-11-02來源:西北高原生物研究所放大 縮小

      10月26日,由中國科學院西北高原生物研究所(中國科學院三江源國家公園研究院)主持完成的青海省重大科技專項“三江源區代表性動物基因資源保護與應用”項目通過驗收。項目由中國科學院西北高原生物研究所、動物研究所、昆明動物研究所和青海大學相關團隊共同參與完成。

      項目聚焦三江源國家公園動物多樣性保護的重大科技需求,綜合利用第二代、第三代基因組測序以及染色體構象捕獲技術,共完成了19種青藏高原典型動物高質量參考基因組的組裝;重點解析了雪豹、野牦牛、藏野驢和高原魚類四個代表動物的種群動態歷史和演化特征;綜合利用比較基因組學和生物信息學等大規模數據分析平臺,深度挖掘了高原動物適應寒冷等極端環境的基因資源,搭建了青藏高原動物基因組數據庫平臺,截至項目驗收,數據庫共收錄動物基因組數據超過10TB,存儲動物組織、細胞等樣品3.26萬份,為三江源動物功能基因鑒定和基因資源利用提供技術保障。項目為相關部門提交重大決策咨詢建議3項,發表高水平論文26篇,出版專著2部,培養和引進人才9名,其中國家級人才2名,培養研究生27名。

      以“三代+二代+Hi-C”策略,構建了野牦牛和家牦牛染色體水平高質量參考基因組,結合多組學數據發現了牦牛適應青藏高原極端環境的一種新機制,相關成果發表在 Nature Communications,同時被 Science、新華社等多家媒體平臺報道。通過雪豹參考基因組及種群重測序數據,發現青藏高原存在南北兩種雪豹亞型,與其獵物分布較為一致,為青藏高原物種遺傳多樣性及適應提供了新的見解。另外,團隊發現高原魚類演化歷史與青藏高原地質事件相關,瀕危魚類經歷了發全基因組復制,加倍基因主要富集于DNA修復,轉運等與高原環境適應相關通路,研究結果將有助于進一步研究高原魚類的適應性進化,并為魚類的耐逆分子育種提供素材。

      依托項目相關研究成果,成立了青海省首家動植物損害鑒定機構——“中國科學院西北高原生物研究所司法鑒定所”,為相關司法、執法部門提供司法鑒定服務,填補了青海省動植物損害司法鑒定領域的空白。目前已完成動物類司法鑒定 16 起,其中,《野牦牛生態環境損害賠償價值鑒定評估報告》公益訴訟案入選青海發布10件守護青藏高原生態文明高地典型案例,被《法治日報》《青海日報》《檢察日報》《西海綠色發展報》等報道。司法鑒定所的成立及順利運行為該項目科技成果轉化形成了很好的示范作用。

      項目負責人楊其恩研究員作驗收匯報

      

      部分代表性論文封面和相關報道,藏野驢等工作以封面論文發表

      

      搭建青藏高原動物基因組數據庫

      

      依托項目成立了青海省首家動植物損害鑒定機構

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